この慈雲院日草上人は、明治16年に22歳で当山の住職となるが、37歳の時、自身の病をきっかけに中山法華経寺での寒百日の荒行後精神病の人々を約30年間山内に収容し、読経祈祷にて治療を行う。

昭和4年に石神井に施設を移転し「石神井慈療院」という病院として開設。同6年には日草上人の院号からその名を冠し「慈雲堂病院」と改称し今日更に発展を遂げている。